More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1816 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  84.27 
 
 		 267 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  77.52 
 
 		 270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  70.47 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  60.16 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  57.59 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  53.82 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  54.47 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  57.09 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  51.37 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  55.21 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  52.31 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  50.19 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  44.4 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  41.86 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  40.55 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  40.55 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  43.08 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  41.31 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  41.7 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  39.62 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  39.77 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  40.15 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  40.76 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  39.76 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  40.54 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  42.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  42.25 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  40.54 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  40.71 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  41.46 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  43.3 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  43.56 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  43.05 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  43.05 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  40.08 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  43.05 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  43.05 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  41.52 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  37.45 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  42.6 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  42.6 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  43.3 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  42.6 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  38.61 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  40 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  37.36 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  41 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  43.24 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  39.61 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  43.3 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  43.24 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  40.23 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  43.24 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  39.53 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  39.62 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  38.76 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  38.52 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  41.52 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  39.25 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  38.49 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  40.16 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  41.32 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  42.92 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  38.91 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  41.94 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  38.91 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  38.08 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  41.82 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  37.89 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  38.52 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  42.67 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  38.74 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  41.78 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  42.22 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  39.38 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  41.78 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  41.67 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  38.43 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  40.71 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  42.91 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  39.69 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  39.77 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  41.78 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  41.67 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>