More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0676 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  50.2 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  51.76 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  50.2 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  50.58 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  51.87 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  50.79 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  47.45 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  49.6 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  48.22 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  48.12 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  53.39 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  48.12 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  52.31 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  50.84 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  48 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  47.6 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  47.6 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  54.59 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  47.64 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  46.19 
 
 		 328 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  44.36 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  44.44 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  45.53 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  44.23 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  44.72 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  44.23 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  44.35 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  47.62 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  46.09 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  47.79 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  46.09 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  44.66 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  44.8 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  44.8 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  45.31 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  43.19 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  42.31 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  43.58 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  44.3 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  41.8 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  43.5 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  42.29 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  42.41 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  45.19 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  42.41 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  41.25 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  42.35 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  43.6 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  43.08 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  45.66 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  44.89 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  44.63 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  43.08 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  44.29 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  43.67 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  43.67 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  48.17 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  45.09 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  43.56 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  42.8 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  42.69 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  42.8 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  44.27 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  47.35 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  43.7 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  46.3 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  46.9 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  40.93 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  46.3 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  46.3 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  46.3 
 
 		 260 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  46.3 
 
 		 260 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  45.54 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  46.3 
 
 		 260 aa  190  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  41.92 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  44.63 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  44.63 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  41.92 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  44.63 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  41.92 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  44.63 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>