More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0365 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
246 aa  490  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  52.81 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  53.39 
 
 
256 aa  231  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  46.25 
 
 
261 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  45.49 
 
 
256 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  44.58 
 
 
256 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  46.22 
 
 
257 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  48.51 
 
 
258 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  49.14 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  44.94 
 
 
257 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  41.53 
 
 
270 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  42.15 
 
 
267 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  44.25 
 
 
260 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  44.35 
 
 
257 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  42.75 
 
 
257 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  44.25 
 
 
260 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  44.25 
 
 
260 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  43.32 
 
 
255 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 
258 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 
258 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  39.92 
 
 
267 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  45.02 
 
 
269 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  43.39 
 
 
258 aa  185  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  44.03 
 
 
260 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  39.09 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  39.26 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  43.93 
 
 
260 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  39.26 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  39.17 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  39.17 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  37.14 
 
 
258 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  40.17 
 
 
258 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  43.4 
 
 
270 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  37.7 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  38.12 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  38.57 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  37.04 
 
 
258 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  43.66 
 
 
268 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  37.14 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  37.23 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  38.1 
 
 
265 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.62 
 
 
263 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  39.18 
 
 
267 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  38.62 
 
 
263 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  35.92 
 
 
263 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  39.26 
 
 
262 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  41.63 
 
 
258 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  37.19 
 
 
259 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  41.08 
 
 
257 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  41.83 
 
 
264 aa  168  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  37.25 
 
 
255 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  38.29 
 
 
255 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  37.84 
 
 
255 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  40.74 
 
 
263 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  36.13 
 
 
261 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  36.1 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  35.37 
 
 
255 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  38.57 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  36.58 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  40 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  36.73 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  36.73 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  40.59 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  35.1 
 
 
265 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  37.38 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  34.47 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  36.33 
 
 
261 aa  161  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  40.47 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  41.37 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  34.29 
 
 
262 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  36.33 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  36.33 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  35.74 
 
 
261 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  35.95 
 
 
258 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  39.55 
 
 
250 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  35.92 
 
 
265 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  38.32 
 
 
260 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  37.27 
 
 
259 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
255 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  37.55 
 
 
260 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  34.57 
 
 
260 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  33.47 
 
 
265 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  34.19 
 
 
255 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  38.75 
 
 
253 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  35.92 
 
 
261 aa  158  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  34.27 
 
 
259 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  35.02 
 
 
260 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  35.27 
 
 
260 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  35.51 
 
 
265 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  35.89 
 
 
260 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  34.71 
 
 
260 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.25 
 
 
266 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  35.1 
 
 
261 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  35.1 
 
 
261 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  35.1 
 
 
261 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>