More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1886 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
328 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  45.87 
 
 
256 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  46 
 
 
251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  46 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  45.6 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  44.77 
 
 
250 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  42.74 
 
 
256 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  43.28 
 
 
260 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  43.04 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  41.56 
 
 
256 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  39.83 
 
 
258 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  43.27 
 
 
257 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  40.41 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  44.33 
 
 
270 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  40.16 
 
 
247 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  36.07 
 
 
246 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  37.9 
 
 
267 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  39.92 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  40.81 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  43.13 
 
 
248 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  39.5 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  40.24 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  43.66 
 
 
263 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  37.66 
 
 
263 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  34.82 
 
 
266 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.79 
 
 
266 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  41.82 
 
 
258 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  40.17 
 
 
257 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  40.17 
 
 
257 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  37.55 
 
 
260 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  32.39 
 
 
257 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  40.09 
 
 
268 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  40.77 
 
 
261 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  32.68 
 
 
258 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
260 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  37.39 
 
 
260 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  36.55 
 
 
263 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  36.55 
 
 
263 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  37.7 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  37.45 
 
 
253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  33.2 
 
 
258 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  33.2 
 
 
258 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.2 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  36.48 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  35.15 
 
 
264 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  40.43 
 
 
260 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  40.43 
 
 
260 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  38.98 
 
 
261 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  39.92 
 
 
260 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.76 
 
 
260 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  31.15 
 
 
255 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  38.82 
 
 
260 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  40.58 
 
 
265 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 
244 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  40.1 
 
 
265 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  39.44 
 
 
258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  39.61 
 
 
265 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  38.46 
 
 
265 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  41.67 
 
 
260 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  40.58 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  40.58 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  39.84 
 
 
255 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 
382 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  39.84 
 
 
255 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  41.59 
 
 
255 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  41.15 
 
 
255 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  39.13 
 
 
265 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  33.47 
 
 
263 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  39.53 
 
 
260 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  38.53 
 
 
269 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  39.43 
 
 
255 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  39.43 
 
 
255 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  37.65 
 
 
258 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  39.43 
 
 
255 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  39.13 
 
 
266 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  40.69 
 
 
260 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  33.61 
 
 
266 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  39.13 
 
 
265 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  39.44 
 
 
260 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  39.44 
 
 
260 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  39.43 
 
 
255 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  39.13 
 
 
265 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  39.43 
 
 
255 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  35.98 
 
 
263 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  39.73 
 
 
255 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  36.16 
 
 
264 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  39.51 
 
 
265 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  37.45 
 
 
253 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  38.89 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.33 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  40.49 
 
 
275 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  37.86 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  37.24 
 
 
265 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  39.61 
 
 
265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  40.49 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  37.55 
 
 
265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  39.38 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>