More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3461 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  55.79 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  54.36 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  52.52 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  50.44 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  44.81 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  44.3 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  45.26 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  46.35 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  48.03 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  43.91 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35.63 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35.63 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.63 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  38.39 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  36.93 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  40.37 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  35.17 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39.09 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  39.09 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  38.5 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  35.45 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  36.73 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  37.9 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  36.74 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.96 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  37.73 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  37.73 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  36.13 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.37 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  36.99 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  34.98 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  36.8 
 
 		 252 aa  128  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.65 
 
 		 270 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.82 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.23 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  34.67 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32.73 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  36.82 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  34.18 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.62 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.18 
 
 		 261 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.62 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  30.71 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.78 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  32.49 
 
 		 380 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  31.4 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  37.21 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  34.3 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  33.63 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  36.07 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  30.08 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  30.08 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  38.12 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  33.62 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.16 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  29.79 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.13 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  33.91 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  35.47 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  31.4 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  35.94 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  31.49 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  29.06 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.36 
 
 		 370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  29.88 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  32.39 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  31.84 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  30.58 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  30.34 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  30.25 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  32.07 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  31.12 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  31.12 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  31.12 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  31.12 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  29.36 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  31.36 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  31.75 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  31.75 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  33.78 
 
 		 265 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  29.58 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  31.15 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 260 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.53 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  30.71 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  30.71 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  30.29 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  32.78 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  29.24 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>