More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5158 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  66.94 
 
 		 242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  63.04 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  54.36 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  56.33 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  51.04 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  45.8 
 
 		 245 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  45.87 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  46.96 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  43.22 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  37.34 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  35.51 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  36.69 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  40.85 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  34.73 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.65 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  33.07 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  35.86 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  38.56 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  35.45 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.61 
 
 		 380 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  34.98 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  37.08 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  32.11 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  35.27 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  33.95 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  37.79 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.46 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  32.64 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  31.12 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.92 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  32.71 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.05 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.98 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  35.02 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32.46 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  34 
 
 		 370 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.56 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  33.89 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  33.49 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.76 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  35.75 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  30.17 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.89 
 
 		 413 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  32.1 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  33.95 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  32.37 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  30.71 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  33.48 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  31.56 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.56 
 
 		 377 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  31.12 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  29.15 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  34.72 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.43 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  30.04 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  30.45 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  30.74 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  31.8 
 
 		 383 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  28.87 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  30.29 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  30.09 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  28.93 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  30.41 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  35.16 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  30.3 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  29.63 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  31.54 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  35.06 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  31.22 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  32.21 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  29.24 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  30.08 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  29.34 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  31.4 
 
 		 430 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>