More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1553 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  66.53 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  64.5 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  45.8 
 
 		 243 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  44.3 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  42.8 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  43.04 
 
 		 247 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  41.96 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  41.49 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  39.47 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  39.04 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.03 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  37.13 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.68 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  32.7 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  36.41 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  32.2 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.49 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.49 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  33.74 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  34.23 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  34.27 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  34.68 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.19 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.65 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  31.63 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  31.74 
 
 		 377 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  30.64 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  34.06 
 
 		 413 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.17 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  30.64 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  29.05 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  30.71 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  32.85 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  32.16 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  29.82 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  28.51 
 
 		 377 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.24 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.16 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  30.66 
 
 		 384 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  29.15 
 
 		 381 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  30.97 
 
 		 382 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  32.21 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  29.15 
 
 		 381 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  30.09 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  33.67 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  32.57 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  28.57 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  32.7 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  33.51 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  31.22 
 
 		 261 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  28.99 
 
 		 380 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  32.2 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  26.86 
 
 		 385 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  32.1 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.23 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  32.41 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  26.83 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  29.36 
 
 		 383 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.75 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  28.51 
 
 		 384 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  27.88 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  26.61 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 		 378 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  31.48 
 
 		 378 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  30.3 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  27.88 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  28.69 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.58 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  30.24 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  33.13 
 
 		 376 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.94 
 
 		 382 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  27.31 
 
 		 381 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  35.85 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  30.57 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  27.62 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  28.23 
 
 		 374 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  28.23 
 
 		 374 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  32.08 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  27.31 
 
 		 382 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  27.27 
 
 		 382 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  33.83 
 
 		 265 aa  89  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  27.14 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  26.84 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  29.52 
 
 		 382 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  28.23 
 
 		 374 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  33.5 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  28.23 
 
 		 447 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>