More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1915 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  100 
 
 		 381 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  98.95 
 
 		 381 aa  750    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  66.75 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  70.35 
 
 		 377 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  70.08 
 
 		 377 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  70.35 
 
 		 377 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  69.19 
 
 		 377 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  65.44 
 
 		 382 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  63.49 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  67.48 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  63 
 
 		 384 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  59.1 
 
 		 382 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  51.46 
 
 		 376 aa  362  6e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  51.85 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  48.95 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  47.34 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  47.07 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  43.67 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  42.06 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  44.66 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  45.25 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  44.15 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  41.55 
 
 		 406 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  43.86 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  42.67 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  44.07 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  40.11 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  38.72 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.7 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  40.33 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  41 
 
 		 430 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  41.39 
 
 		 344 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  36.93 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  37.91 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  38.4 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  38.2 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  41.79 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  39.04 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.38 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  34.95 
 
 		 368 aa  230  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  37.12 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.25 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.6 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  38.11 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  39.06 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  38.36 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  37.97 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  38.04 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  38.92 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  39.22 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  37.05 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  40.65 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  38.89 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  40.9 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  39.78 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  39.44 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  37.16 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  38.13 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  40.96 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  41.14 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  33.51 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  38.07 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  37.88 
 
 		 395 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  41.18 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  37.54 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  42.11 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  35.94 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  35.94 
 
 		 369 aa  209  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  35.12 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  35.62 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  36.58 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  33.97 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  37.19 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  33.42 
 
 		 374 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  40.24 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  35.66 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.25 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  35.14 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  35.58 
 
 		 374 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  35.54 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  35.62 
 
 		 447 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  34.88 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.62 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  36.21 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  36.57 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  34.1 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.73 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.13 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  33.75 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  33.75 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 404 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>