More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4625 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  753    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  45.57 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  43.44 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  39.9 
 
 		 375 aa  242  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  38.67 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  37.33 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  38.41 
 
 		 380 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  40.39 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  40.79 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  33.24 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  39.29 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  43.11 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  45.52 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.23 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  37.53 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.33 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  38.83 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  44.67 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  34.55 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.58 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  34.04 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  37.54 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  33.77 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  41.76 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  34.45 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  35.69 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  36.56 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  39.52 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  37.06 
 
 		 430 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  33.63 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  43.27 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  37.88 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  33.88 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  31.97 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  30.29 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.54 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  40.15 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  35.1 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  38.21 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  31.48 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  40.69 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  31.67 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  33.03 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  39.3 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  34.99 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  31.17 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.94 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  33.45 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.94 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  38.46 
 
 		 382 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  43.39 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  38.02 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  33.45 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  29.95 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  36.57 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.57 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  35.36 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.11 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.09 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  31.11 
 
 		 368 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  35.71 
 
 		 366 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  35.54 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  39.29 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  38.26 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  34.96 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  39.29 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.57 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  32.93 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.59 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  32.58 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  32.58 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  34.02 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.57 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  29.56 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  37.37 
 
 		 377 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  31.59 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  33.46 
 
 		 425 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  40.73 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  36.28 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  29.81 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.92 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  30.75 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  35.27 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  40.32 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  31.94 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  36.63 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  35.81 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  30.6 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  35.81 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  33.68 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  35.25 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  31.94 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39.75 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  33.72 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  35.51 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>