More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2414 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  53.89 
 
 		 401 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  57.01 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  51.82 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  51.24 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  45.57 
 
 		 376 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  46.8 
 
 		 369 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  46.87 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  45.99 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  44.66 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  43.21 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  44.78 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  39.58 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  48.96 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  42.28 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  43.26 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  42.18 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  38.4 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  41.49 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  41.33 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  39.93 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  36.17 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  38.44 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  36.22 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.44 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  37.46 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  33.15 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  40.33 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000795041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  36.27 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  29.72 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  29.89 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  30.53 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  39.16 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  40 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  38.38 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  37.99 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  38.78 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  35.25 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  35.95 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  28.65 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  46.34 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.36 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  31.4 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  35.88 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  35.01 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.01 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.36 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  33.2 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  27.78 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  43.95 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.25 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  31.82 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  37.28 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  36.57 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  34.83 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  38.93 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.23 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  37.38 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.24 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  37.38 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  31.94 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.89 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  36.9 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  39.62 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  32.8 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  32.17 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  32.14 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  38.85 
 
 		 377 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  36.51 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  31.83 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  36.53 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  36.53 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  32.71 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  34.88 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.48 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  30.05 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  32.64 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  36.13 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.78 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  37.5 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  32.36 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.26 
 
 		 256 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  30.21 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  35.2 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  29.67 
 
 		 447 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  31.09 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.05 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  28.74 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  33.21 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  34.54 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  36.43 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  35.06 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  34.54 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  36.64 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  28.38 
 
 		 383 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>