More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1711 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  712    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000795041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  37.82 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  40.44 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  39.22 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  36.24 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  38.4 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  37.93 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  30.5 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.8 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  29.79 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  36.18 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.58 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  41.04 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  32.09 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  34.66 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  32.54 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  33.43 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.04 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  35.52 
 
 		 372 aa  165  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  36.69 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.52 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  34.7 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.68 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  33.96 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  36.68 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  33.2 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  36.53 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  34.38 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  36.06 
 
 		 430 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.65 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  32.02 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  35.27 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  34.75 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  33.82 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  34.62 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  25.48 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  31.71 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  32.55 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  29.61 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  27.1 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  29.33 
 
 		 384 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  25.87 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  35.11 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  26.13 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  38.75 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  30.3 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.34 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  31.66 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  34.4 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  32.86 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  28.14 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  25.33 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  33.15 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  32.61 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  30.66 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  27.86 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  29.72 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.38 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  32.97 
 
 		 372 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  34.52 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  35.38 
 
 		 377 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.76 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  30.71 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  27.12 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  31.29 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  33.75 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  32.81 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.91 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  32.9 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  39.5 
 
 		 258 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  32.1 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  36.51 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.47 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  37.39 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  29.19 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  34.05 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  28.05 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  29.09 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  34.35 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.58 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.31 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  36.48 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  34.96 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  32.77 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.54 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  31.95 
 
 		 374 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  36.62 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  31.95 
 
 		 374 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  31.93 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  29.81 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  30.38 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  32.96 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  28.81 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  30.82 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  37.4 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  37.93 
 
 		 264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  32.39 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>