More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2030 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  753    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  97.59 
 
 
374 aa  736    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  44.94 
 
 
377 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  44.94 
 
 
377 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  40.84 
 
 
383 aa  266  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  38.94 
 
 
413 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  36.58 
 
 
377 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  35.83 
 
 
373 aa  235  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  34.57 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  36.47 
 
 
376 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  36.34 
 
 
369 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  36.34 
 
 
387 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  36.07 
 
 
369 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 
366 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  35.79 
 
 
369 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.82 
 
 
365 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.06 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  34.14 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  37.54 
 
 
366 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  50.47 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  34.7 
 
 
370 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  36.24 
 
 
384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.72 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  38.13 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  37.98 
 
 
430 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  35.65 
 
 
406 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  36.05 
 
 
379 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  34.15 
 
 
396 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  34.15 
 
 
372 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  48.11 
 
 
368 aa  206  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  36.23 
 
 
364 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  35.31 
 
 
368 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  34 
 
 
373 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  31.23 
 
 
380 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.47 
 
 
364 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  34.71 
 
 
367 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  31.82 
 
 
377 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  33.73 
 
 
344 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  34.63 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  35.93 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  41.04 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  33.88 
 
 
382 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  31.04 
 
 
378 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  40.67 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  31.68 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  33.7 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  33.15 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  31.96 
 
 
377 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  30.25 
 
 
378 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  31.86 
 
 
388 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  31.93 
 
 
377 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  29.16 
 
 
383 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  28.79 
 
 
377 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  38.54 
 
 
377 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  43.75 
 
 
384 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  30.53 
 
 
378 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.25 
 
 
377 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  31.12 
 
 
376 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  33.77 
 
 
377 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  40.38 
 
 
382 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  31.32 
 
 
378 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  32.71 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  34.87 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  32.71 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  37.14 
 
 
377 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  32.32 
 
 
393 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  30.75 
 
 
375 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  28.79 
 
 
383 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  29.28 
 
 
383 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.18 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  38.19 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  38.19 
 
 
374 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  32.1 
 
 
394 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  32.1 
 
 
474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  32.66 
 
 
378 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.88 
 
 
379 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  35.14 
 
 
375 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  31.34 
 
 
382 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  32.43 
 
 
371 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  31.71 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  42.52 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  42.52 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  35.33 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  40.44 
 
 
391 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0180  protein of unknown function DUF140  33.53 
 
 
327 aa  178  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  39.29 
 
 
376 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  42.06 
 
 
447 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
374 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  42.06 
 
 
374 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  29.89 
 
 
384 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
365 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  31.72 
 
 
386 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  38.33 
 
 
394 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  40.27 
 
 
373 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  33.42 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  39.27 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  29.69 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  39.27 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  39.27 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>