More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  98.95 
 
 		 381 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  100 
 
 		 381 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  66.49 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  70.35 
 
 		 377 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  69.81 
 
 		 377 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  69.27 
 
 		 377 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  68.65 
 
 		 377 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  63.49 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  65.17 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  66.94 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  63 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  59.63 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  51.46 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  51.85 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  48.95 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  47.34 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  47.07 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  43.67 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  44.38 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  44.82 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  45.25 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  44.15 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  43.86 
 
 		 366 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  41.55 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  42.67 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  44.07 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  39.84 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  38.97 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  41.39 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  39.67 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.9 
 
 		 388 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  39.07 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  36.93 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  35.22 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  42.07 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  38.2 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  37.36 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.38 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.55 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  38.12 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  37.12 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  38.77 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  39.34 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.33 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  37.97 
 
 		 474 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  38.48 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  37.57 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  39.22 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  37.74 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  38.65 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.17 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  39.84 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  35.14 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  40.06 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  39.52 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  41.27 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  39.44 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  40.84 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  37.6 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  37.88 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.76 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  41.32 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  36.25 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  33.24 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  36.25 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  40.81 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  35.12 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  36.97 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  35.94 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  34.25 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  36.58 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  33.7 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  37.02 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  39.94 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  35.43 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  35.36 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  35.36 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  35.26 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.78 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  34.06 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  36.57 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.43 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.73 
 
 		 380 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  34 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  34 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  35.92 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.59 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  34.83 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>