More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2342 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  802    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  63.88 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  41.79 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  41.21 
 
 		 396 aa  275  8e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  40.93 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  43.09 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  46.36 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  41.02 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  43.09 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  44.85 
 
 		 366 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  38.87 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  40.5 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  41.87 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  44.58 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  40.59 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  43.88 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  44.09 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  41.39 
 
 		 377 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  42.59 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  40.06 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  39.07 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  41.99 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.77 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  42.82 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  42.4 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  41.39 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  41.92 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  40.17 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  42.18 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  43.61 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  44.34 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  40.53 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  41.79 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  40.87 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  42.44 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  42.47 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  40.22 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  44.07 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  43.87 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  42.07 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  43.56 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  40.85 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  43.65 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  39.31 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  34.37 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  40.97 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  41.55 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  38.78 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  44.24 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  41.53 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  41.55 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  39.78 
 
 		 384 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.43 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  37.88 
 
 		 376 aa  236  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  36.39 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  39.93 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  38.9 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  36.34 
 
 		 373 aa  232  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  38.83 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  37.67 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  38.38 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  37.87 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  37.47 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.06 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  32.7 
 
 		 369 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32.97 
 
 		 369 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  32.43 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  38.83 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  38.87 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  35.65 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  35.65 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  39.58 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  34.1 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  34.4 
 
 		 374 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  35.66 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  34.42 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  34.13 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.31 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.04 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  35.01 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.65 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  36.14 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  36.99 
 
 		 370 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  36.31 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  34.17 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  35.28 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  33.16 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  34.13 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  35.28 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  37.27 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>