More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3500 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  59.26 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  56.43 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  57.94 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  55.82 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  55.5 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  55.46 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  55.32 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  55.44 
 
 		 377 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  53.58 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  53.58 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  52.42 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  52.8 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  56.33 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  52.66 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  48.74 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  48.46 
 
 		 382 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  48.46 
 
 		 381 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  46.4 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  47.44 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  43.82 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  45.48 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  43.82 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  48.94 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  46.18 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  45.59 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  45.87 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  42.9 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  40.97 
 
 		 387 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  43.54 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  46.48 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  42.98 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  42.47 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  44.18 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  41.81 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  40.84 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  40.46 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  43.91 
 
 		 385 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  40.94 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  39.11 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  41.96 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.52 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  41.53 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  38.61 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  40.46 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  40.11 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  39.84 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  37.67 
 
 		 406 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  40.5 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  39.94 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  37.06 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  39.67 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.08 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  38.32 
 
 		 377 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  36.98 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  38.44 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  34.79 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.85 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  34.37 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  36.49 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  38.67 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  35.54 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  36.01 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  32.24 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 		 377 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  32.12 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  37.86 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.94 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.67 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.94 
 
 		 369 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  38.25 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.74 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.12 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.12 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.26 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  33.86 
 
 		 371 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.39 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  28.57 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.55 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  33.82 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  34.59 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  34.12 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  32.21 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  34.44 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  34.44 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  30.6 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  31.2 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  30.56 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  33.03 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  31.53 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  31.53 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.25 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  38.08 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.64 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  32.24 
 
 		 384 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.64 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.64 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  38.94 
 
 		 376 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>