More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2006 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  98.64 
 
 
369 aa  729    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  98.64 
 
 
369 aa  726    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  100 
 
 
369 aa  737    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  63.94 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  46.56 
 
 
376 aa  330  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  45.48 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  46.6 
 
 
368 aa  275  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  44.94 
 
 
367 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  43.82 
 
 
373 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  44.1 
 
 
368 aa  265  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  37.36 
 
 
377 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
377 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.36 
 
 
377 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  36.24 
 
 
374 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  35.79 
 
 
374 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.15 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  32.7 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  34.9 
 
 
384 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  31.78 
 
 
377 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  31.78 
 
 
383 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  32.64 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  32.36 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  34.43 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  34.14 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.34 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  33.03 
 
 
378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.42 
 
 
413 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  31.69 
 
 
430 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  33.63 
 
 
378 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  33.63 
 
 
378 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  30.61 
 
 
383 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  32.93 
 
 
344 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.09 
 
 
382 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  42.03 
 
 
376 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  33.23 
 
 
378 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  33.52 
 
 
388 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  31.44 
 
 
388 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  34.43 
 
 
372 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  33.86 
 
 
385 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  33.24 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  32.29 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
366 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.24 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  33.6 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  33.9 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  33.6 
 
 
374 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  33.6 
 
 
374 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  35.94 
 
 
381 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  32.22 
 
 
474 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.6 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  33.23 
 
 
366 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  32.71 
 
 
366 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  34.8 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  35.62 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  38.32 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0180  protein of unknown function DUF140  38.86 
 
 
327 aa  198  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  29.92 
 
 
382 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  33.63 
 
 
378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  32.69 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  34.38 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  34.06 
 
 
396 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.21 
 
 
377 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  35.87 
 
 
382 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  34.93 
 
 
377 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  34.76 
 
 
375 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  34.89 
 
 
384 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  35.49 
 
 
377 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  38.76 
 
 
368 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  32.73 
 
 
376 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  31.64 
 
 
382 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  31.07 
 
 
375 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  40.31 
 
 
374 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  42.68 
 
 
379 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  29.12 
 
 
382 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  33.79 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  34.56 
 
 
373 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  40.08 
 
 
371 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  34.53 
 
 
376 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  40.31 
 
 
374 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  40.31 
 
 
374 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  28.85 
 
 
382 aa  189  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  29.69 
 
 
381 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  30.06 
 
 
380 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  29.44 
 
 
384 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  33.83 
 
 
378 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  33.83 
 
 
378 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  34.24 
 
 
379 aa  186  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  28.73 
 
 
370 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  32.29 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  33.03 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  31.48 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  33.45 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 
366 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  32.41 
 
 
395 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 
366 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>