More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5557 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  100 
 
 		 377 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  78.51 
 
 		 377 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  74.54 
 
 		 377 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  73.47 
 
 		 383 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  73.47 
 
 		 383 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  72.94 
 
 		 383 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  57.87 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  57.49 
 
 		 388 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  57.41 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  55.53 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  56.35 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  56.35 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  58.01 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  59.57 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  53.58 
 
 		 376 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  52.82 
 
 		 382 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  52.82 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  52.82 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  48.94 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  50.41 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  45.58 
 
 		 394 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  48.27 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  49.86 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  48.89 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  44.44 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  45.87 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  45.24 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  44.41 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  43.5 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  43.34 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  43.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  45.15 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  44.01 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  43.24 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  46.22 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  39.37 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  41.09 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  43.02 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  41.76 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  40.05 
 
 		 370 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.53 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  37.67 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  37.47 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  39.74 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  40.36 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  40.18 
 
 		 372 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  36.91 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  36.51 
 
 		 372 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  34.03 
 
 		 376 aa  235  9e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  39.89 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  40.6 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  39.12 
 
 		 376 aa  230  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  36.36 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.05 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.21 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.17 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  40.44 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  40.33 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  38.29 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  38.02 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  39.88 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  34.33 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  40.77 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  35.03 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  32.34 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32.63 
 
 		 369 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  32.34 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  37.11 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  33.89 
 
 		 377 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  33.89 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.73 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.09 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.82 
 
 		 374 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.82 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  38.37 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  38.1 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.02 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  30.26 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  34.86 
 
 		 371 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  32.15 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.94 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  33.07 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  33.07 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  33.07 
 
 		 374 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  33.07 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.07 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.68 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  35.54 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  35.54 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  32.92 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  33.94 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  33.98 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  42.79 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  32.43 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  40.95 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  34.13 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  33.06 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  39.65 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>