More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0373 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  747    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  65.25 
 
 		 382 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  66.94 
 
 		 381 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  67.48 
 
 		 381 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  65.62 
 
 		 382 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  64.56 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  63.19 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  64.75 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  63.74 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  63.64 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  63.64 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  63.64 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  53.99 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  48.81 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  46.74 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  46.58 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  46.3 
 
 		 372 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  44.01 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  46.99 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  43.77 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  44.81 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  46.67 
 
 		 366 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  41.02 
 
 		 430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  39.83 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  42.29 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  43.78 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  40.73 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.84 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  39.23 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  39.47 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  38.57 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.82 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  39.31 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  35.44 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  37.81 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  38.74 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  38.62 
 
 		 377 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.4 
 
 		 388 aa  232  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.2 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  42.11 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  38.11 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  39.34 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  39.63 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  37.37 
 
 		 378 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  38.79 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  44.03 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  37.17 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  34.45 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  39.79 
 
 		 382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  34.72 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  37.8 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  39.63 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  46.12 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  35.68 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  37.91 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  32.26 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  36.25 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  35.83 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  39.17 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.54 
 
 		 413 aa  212  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  36.26 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  40.06 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  35.37 
 
 		 474 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  35.73 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  37.94 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  40.36 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  43.87 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.88 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  32.8 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  33.86 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  44.33 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  35.36 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  37.09 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  35.6 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  42.92 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  34.32 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.73 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.81 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.93 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  32.98 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.25 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  43.81 
 
 		 386 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  32.73 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  34.16 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  34.16 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  33.51 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  32.98 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  34.25 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  35.33 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  32.72 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  32.65 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  32.39 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  40.77 
 
 		 447 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  32.08 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>