More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2004 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  773    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  48.23 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  44.54 
 
 
382 aa  292  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  43.01 
 
 
385 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  38.11 
 
 
396 aa  272  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  45.36 
 
 
377 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  43.87 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  44.66 
 
 
377 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  39.01 
 
 
373 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  41.39 
 
 
366 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  43.87 
 
 
377 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  38.64 
 
 
370 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  41.67 
 
 
366 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  40.46 
 
 
382 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  37.84 
 
 
372 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  43.45 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  39.07 
 
 
406 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  40.36 
 
 
387 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  42.07 
 
 
365 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  40.44 
 
 
384 aa  255  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  42.06 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.32 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  44.82 
 
 
381 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  41.1 
 
 
383 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  42.64 
 
 
377 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  39.13 
 
 
378 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  40.78 
 
 
376 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  42.48 
 
 
384 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  36.87 
 
 
391 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  38.56 
 
 
378 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  38.9 
 
 
378 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  38.5 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  38.59 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  40.36 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  39.88 
 
 
379 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  40.66 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 
365 aa  242  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  37.57 
 
 
382 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  39.57 
 
 
430 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  35.94 
 
 
395 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  38.07 
 
 
377 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  37.67 
 
 
381 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  38.27 
 
 
377 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  38.42 
 
 
382 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  38.67 
 
 
391 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  37.57 
 
 
382 aa  236  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  37.98 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  37.3 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  40.18 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.34 
 
 
368 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.02 
 
 
383 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  37.74 
 
 
379 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  34.44 
 
 
373 aa  225  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  36.62 
 
 
474 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  36.83 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  38.48 
 
 
386 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  36.49 
 
 
376 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  38.94 
 
 
394 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 
377 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  34.37 
 
 
377 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  36.32 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  41.73 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  38.32 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.34 
 
 
413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.99 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  36.53 
 
 
368 aa  210  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.92 
 
 
377 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  32.56 
 
 
367 aa  206  7e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  36.77 
 
 
370 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.68 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  32.52 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  38.02 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.46 
 
 
364 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.04 
 
 
380 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  35.55 
 
 
379 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  29.65 
 
 
370 aa  186  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 
369 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.48 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.2 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  34.59 
 
 
388 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  33.97 
 
 
374 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  43.87 
 
 
376 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  32.31 
 
 
382 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.97 
 
 
374 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  32.82 
 
 
374 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.56 
 
 
379 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  32.82 
 
 
374 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.96 
 
 
376 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  32.61 
 
 
374 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 
374 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  33.6 
 
 
376 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  33.25 
 
 
375 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  32.34 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.29 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  31.2 
 
 
374 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  31.44 
 
 
378 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  31.44 
 
 
378 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  33.42 
 
 
374 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.53 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>