More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4485 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 383 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  84.6 
 
 		 383 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  86.16 
 
 		 383 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  80.9 
 
 		 377 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  78.07 
 
 		 377 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  73.47 
 
 		 377 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  57.03 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  59.1 
 
 		 378 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  56.8 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  57.6 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  57.07 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  55.15 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  58.06 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  60.98 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  55.32 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  54.19 
 
 		 382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  51.44 
 
 		 381 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  53.52 
 
 		 382 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  49.6 
 
 		 377 aa  355  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  49.47 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  48.52 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  50.14 
 
 		 386 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  45.96 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  50.96 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  46.79 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  45.96 
 
 		 365 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  46.74 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  44.12 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  47.68 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  44.85 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  45.57 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  40.48 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  40.47 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  42.36 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  40 
 
 		 370 aa  275  7e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  41.6 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  45.32 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  41.74 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  38.67 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  38.4 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  43.16 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  41.8 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.5 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 		 430 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  41.1 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.94 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  39.53 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  41.32 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  39.78 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  38.02 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  37.57 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.47 
 
 		 377 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  40.5 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  40.5 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  36.13 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.35 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  38.48 
 
 		 371 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  39.61 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  38.97 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  39.34 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  38.69 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  34.75 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  33.42 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  38.48 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.23 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  34.38 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  30.61 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.61 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  33.05 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  30.3 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  34.53 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  39.77 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  35.75 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  34.7 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  35.45 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  32.6 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.16 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.35 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  35.19 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.68 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  28.61 
 
 		 374 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  35.16 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  28.79 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.74 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.66 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  35.19 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  35.19 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  34.19 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  36.69 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  35.01 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.07 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.89 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  34.56 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.54 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  33.15 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.14 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>