More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0468 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
380 aa  762    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  40.05 
 
 
375 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  40.63 
 
 
382 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  36.97 
 
 
383 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  36.77 
 
 
386 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  42.14 
 
 
368 aa  235  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1017  hypothetical protein  44.64 
 
 
385 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  38.41 
 
 
376 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  40.48 
 
 
372 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  44.78 
 
 
384 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.51 
 
 
366 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  36.06 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  31.89 
 
 
376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  37.39 
 
 
366 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  37.29 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  37.4 
 
 
401 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.92 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.38 
 
 
413 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  37.85 
 
 
373 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  34.68 
 
 
384 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  37.13 
 
 
370 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  36.2 
 
 
393 aa  206  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.32 
 
 
377 aa  205  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.23 
 
 
374 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  35.38 
 
 
377 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
377 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.02 
 
 
374 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  33.95 
 
 
447 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  33.95 
 
 
374 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.71 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.77 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  35.2 
 
 
383 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  37.15 
 
 
382 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.74 
 
 
373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  33.42 
 
 
430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  37.15 
 
 
381 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  35.94 
 
 
372 aa  196  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  33.95 
 
 
377 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.64 
 
 
382 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  35.62 
 
 
387 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  37.07 
 
 
382 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  33.64 
 
 
374 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  33.16 
 
 
383 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  37.85 
 
 
362 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.62 
 
 
396 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  33.69 
 
 
377 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  33.82 
 
 
382 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  35.58 
 
 
377 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.73 
 
 
364 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  34.88 
 
 
383 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  35.29 
 
 
377 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  34.66 
 
 
344 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  33.42 
 
 
474 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  33.52 
 
 
379 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  40.07 
 
 
382 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  36.71 
 
 
373 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  37.54 
 
 
381 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  35.92 
 
 
368 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  34.88 
 
 
369 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  41.08 
 
 
385 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.18 
 
 
376 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  34.04 
 
 
384 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  34.12 
 
 
375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.88 
 
 
382 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  35.23 
 
 
375 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  30.06 
 
 
369 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  35.29 
 
 
384 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  33.42 
 
 
377 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  33.02 
 
 
377 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  33.23 
 
 
388 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  43.04 
 
 
379 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  35.8 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.54 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  35.37 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  28.73 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  31.16 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  29.94 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  34.26 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  32.52 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  32.72 
 
 
425 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  31.83 
 
 
371 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  34.02 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  32.53 
 
 
377 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  32.52 
 
 
388 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  40.85 
 
 
370 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  33.03 
 
 
378 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  34.66 
 
 
386 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  35.1 
 
 
370 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
404 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  30.67 
 
 
377 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.44 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.44 
 
 
374 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  32.17 
 
 
376 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  36.75 
 
 
386 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
374 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 
428 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>