More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1985 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 373 aa  743    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  51.82 
 
 		 384 aa  326  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  55.59 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  49.46 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  40.39 
 
 		 376 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  38.95 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  38.02 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  37.63 
 
 		 386 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  40.91 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  41.81 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  39.51 
 
 		 377 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.34 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  42.38 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  38.26 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  40.51 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  38.35 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  30.05 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  41.94 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  31.52 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.86 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.43 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  31.75 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  30.62 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  31.68 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  37.6 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.84 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  39.75 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  39.58 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  37.1 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  35.18 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  32.48 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  28.02 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  30.19 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  36.68 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  30.87 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  30.66 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  29.97 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  29.92 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  33.33 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  30.59 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  33.62 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  30.59 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  37.12 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  34.1 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  37.22 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  33.05 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  30.91 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  34.5 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  30.98 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  30.34 
 
 		 374 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  28.49 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  30.34 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  35.04 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  29.31 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  31.87 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  34.08 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  26.12 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  35.58 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  44.67 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  28.81 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  32.4 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  29.92 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  31.88 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  26.18 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  33.52 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  37.3 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  32.62 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000795041 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  27.58 
 
 		 374 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  26.34 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  35.25 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  31.7 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  32.16 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  38.43 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.63 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  36.33 
 
 		 256 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  33.82 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  34.55 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.92 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  30.14 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  31.21 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  31.65 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  30.86 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  28.96 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  32.13 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  33.45 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  30.86 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  32.34 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  35.06 
 
 		 257 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  32.34 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.88 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  29.41 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  33.23 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.75 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  30.74 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  29.75 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  30.62 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  37.76 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  28.76 
 
 		 388 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>