More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2450 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  43.5 
 
 
256 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  43.91 
 
 
257 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  44.34 
 
 
250 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  40.99 
 
 
383 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  40.95 
 
 
258 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  40.89 
 
 
257 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  42.34 
 
 
263 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  42.34 
 
 
263 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  42.66 
 
 
380 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 
258 aa  175  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  42.4 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  41.85 
 
 
248 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  40.91 
 
 
257 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  41.07 
 
 
377 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  43.44 
 
 
375 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  41.07 
 
 
377 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.8 
 
 
377 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  39.53 
 
 
376 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  38.99 
 
 
413 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  43.95 
 
 
249 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  38.43 
 
 
260 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  41.18 
 
 
386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.96 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  38.86 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  41.59 
 
 
250 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  41.43 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.76 
 
 
373 aa  162  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  37.11 
 
 
247 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  39.37 
 
 
264 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  37.27 
 
 
261 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  38.99 
 
 
255 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  40.54 
 
 
251 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  40.54 
 
 
251 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  39.09 
 
 
256 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  37.73 
 
 
384 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  35.94 
 
 
370 aa  159  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  37.39 
 
 
406 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
251 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.91 
 
 
372 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  39.63 
 
 
373 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  38.29 
 
 
430 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  37.25 
 
 
246 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  38.18 
 
 
256 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  35.32 
 
 
258 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  43.27 
 
 
386 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  39.82 
 
 
260 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  36.17 
 
 
257 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 
366 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  39.15 
 
 
252 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  38.01 
 
 
366 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  37.67 
 
 
366 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  37.32 
 
 
374 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  37.32 
 
 
374 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  41.82 
 
 
275 aa  155  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  40.67 
 
 
382 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  39.29 
 
 
263 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.98 
 
 
396 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  37.17 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  38.1 
 
 
377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  35.56 
 
 
372 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  38.39 
 
 
266 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.81 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.27 
 
 
364 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  33.79 
 
 
369 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2908  hypothetical protein  39.92 
 
 
275 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  37.12 
 
 
260 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  40.28 
 
 
265 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
369 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  33.33 
 
 
369 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  37.9 
 
 
382 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  37.12 
 
 
260 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  37.12 
 
 
260 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  35.43 
 
 
267 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  39.06 
 
 
391 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  34.29 
 
 
385 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  38.05 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  39.19 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  44.81 
 
 
373 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  41.85 
 
 
381 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  38.1 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  41.63 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  38.65 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  35.66 
 
 
381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  38.18 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  33.84 
 
 
270 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  35.66 
 
 
381 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  38.14 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  38.68 
 
 
379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  40.09 
 
 
268 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  38.2 
 
 
365 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  38.97 
 
 
267 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  34.96 
 
 
344 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  35.57 
 
 
388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  41.23 
 
 
395 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  41.01 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  35.37 
 
 
245 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  36.73 
 
 
368 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  35.65 
 
 
370 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>