More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3314 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  62.24 
 
 		 252 aa  317  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  47.92 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  49.17 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  48.52 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  48.95 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  49.32 
 
 		 262 aa  228  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  43.62 
 
 		 269 aa  208  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  42.42 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  40.68 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  37.87 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  38.46 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  36.93 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  36.78 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.8 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  36.97 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  37.39 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  39.39 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.17 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  35.94 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  39.02 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  36.49 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  35.34 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  37.02 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  35.78 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  38.83 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.37 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.34 
 
 		 251 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  34.91 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  35.65 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.56 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  34.91 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  36 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  36 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.28 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  37.98 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  35.55 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  36.32 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.87 
 
 		 384 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.37 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  34.13 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  35.47 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  32.77 
 
 		 386 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  40.09 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.08 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  32.43 
 
 		 376 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.69 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  34.75 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  33.03 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  37.82 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  37.56 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  35.68 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  35.5 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  35.15 
 
 		 380 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  37.25 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.78 
 
 		 413 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  34.08 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  37.56 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  33.02 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  31.6 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  37.33 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  33.02 
 
 		 376 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  32.14 
 
 		 382 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35 
 
 		 383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.92 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  35.14 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.61 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  35.92 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  35.86 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  31.49 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  31.88 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.05 
 
 		 374 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.05 
 
 		 374 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  32.99 
 
 		 370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  37.02 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  32.26 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  35.5 
 
 		 366 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  35.5 
 
 		 366 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  33.78 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  34.11 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  31.4 
 
 		 388 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  34.17 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.22 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.29 
 
 		 376 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  39.02 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  34.95 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  32.23 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  27.92 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  27.92 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  31.98 
 
 		 265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>