More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1812 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  70.28 
 
 		 269 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  60.97 
 
 		 264 aa  345  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  61.33 
 
 		 263 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  71.49 
 
 		 262 aa  321  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  47.46 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  47.92 
 
 		 245 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.43 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  35.85 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  34.26 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.87 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.24 
 
 		 382 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  41.46 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.67 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  31.91 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  39.23 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  37.84 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  37.84 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.89 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  36.75 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  32.66 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.05 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  33.48 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  33.8 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  32.66 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  32.69 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  35.75 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  36.41 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  34.3 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  31.8 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.3 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.01 
 
 		 383 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.23 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  35 
 
 		 380 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  33.89 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  33.48 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  34.45 
 
 		 372 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  32.93 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  37.89 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  34.23 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  34.43 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  36.21 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.77 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  30.87 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.38 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  33.62 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  35.12 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  32.58 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  31.67 
 
 		 376 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  31.51 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  34.8 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  30.81 
 
 		 376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  35.37 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  37.2 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  34.8 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  29.6 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  33.17 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  31.85 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  39.45 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.08 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.08 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.08 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  32.49 
 
 		 386 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  30.31 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  31.13 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  32.81 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  35.1 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  35.1 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  33.01 
 
 		 365 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  33.61 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  34.02 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  33.5 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  28.94 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  30.15 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  29.15 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  37.07 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 		 374 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  35.98 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.06 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.71 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  35.52 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  32.68 
 
 		 370 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  33.04 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  30.66 
 
 		 375 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  36.73 
 
 		 261 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4017  protein of unknown function DUF140  35.51 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0789567  normal  0.274799 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  33.49 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  35.78 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  35.24 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  34.25 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  35.59 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>