More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4017 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4017  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
249 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0789567  normal  0.274799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  90.73 
 
 
249 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1749  hypothetical protein  87.1 
 
 
249 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.627131  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1817  toluene tolerance protein  87.1 
 
 
249 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  48.93 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  47.35 
 
 
260 aa  218  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  46.53 
 
 
260 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  46.94 
 
 
260 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
255 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  46.94 
 
 
260 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  46.94 
 
 
260 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  46.12 
 
 
260 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  47.97 
 
 
260 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  46.12 
 
 
260 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  47.56 
 
 
260 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  47.33 
 
 
258 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  49.54 
 
 
255 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  49.54 
 
 
255 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  46.12 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  46.12 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  46.12 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  47.21 
 
 
265 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  46.94 
 
 
260 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  50.47 
 
 
263 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  48.12 
 
 
259 aa  215  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0686  hypothetical protein  50.7 
 
 
260 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  48.83 
 
 
265 aa  214  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  45.71 
 
 
260 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  49.07 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  49.07 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  45.14 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  50 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  47.35 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  49.07 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  50.7 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  48.36 
 
 
262 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  50 
 
 
255 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  50.23 
 
 
260 aa  211  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  45.61 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  48.66 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  44.49 
 
 
261 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  47.98 
 
 
263 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  47.33 
 
 
258 aa  209  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  51.17 
 
 
260 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2936  hypothetical protein  49.11 
 
 
260 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  50.47 
 
 
255 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  47.89 
 
 
262 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  50.47 
 
 
255 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  47.44 
 
 
260 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  46.53 
 
 
263 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  45.23 
 
 
263 aa  207  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  46.64 
 
 
266 aa  207  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  47.44 
 
 
261 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  48.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  47.74 
 
 
260 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  48.89 
 
 
255 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  44.54 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  45.04 
 
 
261 aa  205  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  44.86 
 
 
261 aa  204  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  204  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  43.57 
 
 
265 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  44.54 
 
 
261 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  45.31 
 
 
260 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  42.8 
 
 
260 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  47.89 
 
 
260 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  47.89 
 
 
260 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  48.36 
 
 
260 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  46.19 
 
 
264 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  43.51 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  44.17 
 
 
260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  44.92 
 
 
260 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  42.45 
 
 
265 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  46.69 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  46.69 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>