More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3703 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  93.33 
 
 
255 aa  473  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  92.94 
 
 
255 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  93.33 
 
 
255 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  93.33 
 
 
255 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  92.94 
 
 
255 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  92.94 
 
 
255 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  92.94 
 
 
255 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  89.02 
 
 
255 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  89.02 
 
 
255 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  87.45 
 
 
255 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  79.22 
 
 
255 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  79.22 
 
 
255 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  77.29 
 
 
265 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  76.49 
 
 
262 aa  380  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  79.84 
 
 
258 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  77.65 
 
 
255 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  75.7 
 
 
260 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  79.92 
 
 
258 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  73.52 
 
 
260 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  76.95 
 
 
260 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  74.5 
 
 
260 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  72.94 
 
 
264 aa  357  8e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  70.78 
 
 
260 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  70.78 
 
 
260 aa  343  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  77.03 
 
 
259 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  78.12 
 
 
260 aa  341  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2936  hypothetical protein  71.02 
 
 
260 aa  339  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0686  hypothetical protein  71.19 
 
 
260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  66.4 
 
 
262 aa  322  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  63.64 
 
 
265 aa  318  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  63.24 
 
 
263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  60 
 
 
262 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  60.78 
 
 
258 aa  293  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  59.29 
 
 
259 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  62.9 
 
 
258 aa  291  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  58.66 
 
 
263 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  60.08 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  59.6 
 
 
263 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  58.89 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  58.5 
 
 
264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  59.14 
 
 
258 aa  284  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  64.07 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  61.35 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  61.6 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  63.64 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  60.47 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  65.9 
 
 
265 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  59.29 
 
 
263 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  64.06 
 
 
265 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  65.44 
 
 
265 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  62.34 
 
 
260 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  63.68 
 
 
260 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  65.44 
 
 
265 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  60.08 
 
 
260 aa  278  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  62.34 
 
 
260 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  62.34 
 
 
260 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  57.59 
 
 
260 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  64.06 
 
 
266 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  64.52 
 
 
265 aa  278  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  63.59 
 
 
265 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  65.73 
 
 
265 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  60.58 
 
 
260 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  58.5 
 
 
261 aa  277  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  64.06 
 
 
265 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  63.59 
 
 
265 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  63.59 
 
 
265 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  64.35 
 
 
265 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  64.09 
 
 
260 aa  275  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  59.29 
 
 
260 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  62.01 
 
 
261 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  64.35 
 
 
260 aa  274  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  56.32 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  56.86 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  57.09 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  57.31 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  57.31 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  57.31 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  57.65 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  57.31 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  56.92 
 
 
261 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  57.31 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  62.01 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  59.34 
 
 
260 aa  271  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  59.34 
 
 
260 aa  271  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  59.83 
 
 
261 aa  271  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>