More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0705 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  45.49 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  39.84 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  43.62 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  41.56 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  42.36 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  40.45 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  39.41 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  39.21 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  38.33 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.96 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.06 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  35.04 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  33.88 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  37.05 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  37.05 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  37.71 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  36.48 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  32.79 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  37.29 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  37.71 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  36.99 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  36.29 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  32.79 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  35.15 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  35.63 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.81 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.58 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  35.74 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  35.04 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  35.06 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  38.89 
 
 		 375 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  36.18 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.89 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  34.15 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  35.66 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  34.8 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  36.03 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  35.89 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  35.54 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  36.03 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.74 
 
 		 374 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  35.16 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.74 
 
 		 374 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  34.67 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  37.5 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  34.96 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  34.68 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  37.56 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  33.05 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  34.63 
 
 		 376 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  34.48 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  36.94 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  32.23 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  33.09 
 
 		 374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  38.71 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  33.09 
 
 		 447 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.44 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  34.6 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  34.73 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  34.35 
 
 		 386 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  33.75 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  35.85 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  32.46 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  31.35 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  37.99 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  33.61 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  31.98 
 
 		 380 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.5 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  34.58 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.64 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  32.47 
 
 		 374 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 		 374 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  35.05 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  32.71 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  32.71 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  36.82 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  32.11 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  33.74 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  31.33 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  31.09 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  31.46 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  33.77 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  35.12 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  36.78 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  34.54 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.19 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  36.07 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  38.53 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  34.84 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  30.68 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  33.74 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>