More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1871 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  88.42 
 
 		 264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  83.27 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  79.92 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  79.55 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  82.28 
 
 		 256 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  83.07 
 
 		 264 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  36.89 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  36.55 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  38.14 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  38.03 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.84 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  37.09 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  35.34 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.66 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  30.83 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.88 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.74 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  37.55 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  32.52 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  33.94 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.17 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  34.4 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.32 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  34.56 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  32.03 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  32.03 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  33.08 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  32.76 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  33.48 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  35.06 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  34 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  34.45 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  32.64 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  36.27 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.65 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  33.04 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.48 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  36.15 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  33.19 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  36.56 
 
 		 430 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  32.72 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  32.91 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  32.91 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  34.06 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  30.17 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  36.18 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.57 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  34.43 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  32.17 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  36.13 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  32.17 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  34.76 
 
 		 406 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.85 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  31.12 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  33.67 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  32.77 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  36.12 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  31.06 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  31.14 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  32.9 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  31.14 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  31.14 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.76 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  32.33 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  32.44 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  34.86 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  32.33 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  35.75 
 
 		 384 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  32.33 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  32.44 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  30.26 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  33.19 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  34.33 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>