More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1737 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  87.12 
 
 		 264 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  86.36 
 
 		 264 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  84.47 
 
 		 264 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  79.55 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  87.4 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  82.95 
 
 		 264 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  37.96 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.14 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  33.88 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  35.35 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.52 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  35.02 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.42 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  32.03 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  32.23 
 
 		 258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  32.52 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.17 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.9 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.56 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  32.77 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  32.77 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  35.12 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.05 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.76 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  34.05 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.3 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  33.2 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  36.68 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  32.52 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  34.8 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  37.25 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  34.07 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  31.69 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.22 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  32.27 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  36.13 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.67 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  30.96 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  30.61 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  32.71 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  30.93 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  34.8 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.04 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.5 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.5 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  30.27 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  31.08 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  30.9 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.9 
 
 		 328 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  32.31 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  30.99 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  32.31 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  31.86 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  32.31 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  31.88 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  31.88 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  31.88 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.23 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  30.09 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  30.08 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  30.68 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  29.73 
 
 		 261 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  31.22 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  31.88 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  31.8 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  31.44 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  29.8 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  34.91 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  29.57 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  31.67 
 
 		 396 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  31.66 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 430 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.43 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  27.8 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  30.09 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  31.6 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  33.18 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  33.61 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  33.95 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  31.67 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  32.77 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  30.09 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  27.2 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>