More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0701 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  72.43 
 
 		 260 aa  359  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  72.84 
 
 		 250 aa  358  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  68.83 
 
 		 285 aa  351  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  72.29 
 
 		 267 aa  341  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  68.72 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  70.49 
 
 		 267 aa  328  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  67.9 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  64.26 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  51.64 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  52.36 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  51.22 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  51.22 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  51.22 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  51.93 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  53.25 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  47.76 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  47.76 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  46.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  47.76 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  46.06 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  49.17 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  50.82 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  47.76 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  47.01 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  47.76 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  47.76 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  46.46 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  47.15 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  51.19 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  49.18 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  47.35 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  46.69 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  48.74 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  47.95 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  46.31 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  46.31 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  46.31 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  46.31 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  45.2 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  48.32 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  48.75 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  45.9 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  51.43 
 
 		 262 aa  225  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  44.66 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  47.48 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  51.93 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  44.05 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  44.84 
 
 		 281 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  48.46 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  48.46 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  48.46 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  45.35 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  48.52 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  47.49 
 
 		 349 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  48.15 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  42.55 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  42.53 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  40.94 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  40.91 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.76 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.05 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  34.7 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.8 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  35.32 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.87 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  35.53 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  49.63 
 
 		 141 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.2 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  36.8 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.43 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.43 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  36.86 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  36.86 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.2 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.61 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.51 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  32.38 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.91 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  30.93 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  30.08 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  32.42 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  30.96 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  30.38 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  30.51 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  30.51 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.82 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  33.6 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.54 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.51 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  34.31 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.36 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  32.5 
 
 		 384 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  34.22 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>