More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1522 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  75.98 
 
 
255 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  75 
 
 
250 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  73.62 
 
 
257 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  73.12 
 
 
255 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  74.7 
 
 
256 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  71.54 
 
 
257 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  74.19 
 
 
255 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  64.78 
 
 
254 aa  334  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  64.78 
 
 
254 aa  331  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  64.26 
 
 
254 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  64.26 
 
 
254 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  62.84 
 
 
269 aa  327  9e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  62.5 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  62.84 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  62.5 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  62.5 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  62.6 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  67.81 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  62.6 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  62.6 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  62.86 
 
 
269 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  66.52 
 
 
237 aa  324  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  62.6 
 
 
270 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  62.6 
 
 
270 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  62.6 
 
 
270 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  61.35 
 
 
270 aa  321  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  60.37 
 
 
269 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  60.89 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  60.24 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  59.5 
 
 
265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  59.11 
 
 
265 aa  298  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  60.08 
 
 
265 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  70.77 
 
 
255 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  58.47 
 
 
265 aa  291  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  58.37 
 
 
265 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  58.37 
 
 
265 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  58.37 
 
 
265 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  47.84 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  46.06 
 
 
261 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  41.82 
 
 
285 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  44.63 
 
 
250 aa  221  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  47.77 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  43.39 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  44.79 
 
 
267 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  46.4 
 
 
268 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  41.39 
 
 
267 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  68.89 
 
 
141 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  42.31 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  41.67 
 
 
262 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  42.68 
 
 
257 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  40.93 
 
 
269 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  38.69 
 
 
285 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  36.07 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  35.62 
 
 
312 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  39.51 
 
 
285 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11994  integral membrane protein YrbE3a  63.3 
 
 
132 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  38.6 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  37.01 
 
 
272 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  36.98 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5634  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  59.2 
 
 
206 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639594  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  32.39 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  30.64 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  30.96 
 
 
256 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 
263 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  35.08 
 
 
297 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 
263 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  31.93 
 
 
271 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  31.3 
 
 
430 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.13 
 
 
258 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  31.98 
 
 
245 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  30.23 
 
 
257 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.34 
 
 
256 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  30.08 
 
 
328 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  29.26 
 
 
252 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.71 
 
 
261 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  31.17 
 
 
376 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  29.52 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  34.09 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  28.82 
 
 
267 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
366 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  28.93 
 
 
267 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  32.8 
 
 
261 aa  99  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  33.14 
 
 
366 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  29.24 
 
 
264 aa  99  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  27.5 
 
 
268 aa  99  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  30.98 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  29.15 
 
 
385 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  29.33 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  30.99 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.11 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  34.18 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  34.05 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  34.05 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  34.05 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  34.05 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>