More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4619 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  98.82 
 
 
254 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  90.84 
 
 
254 aa  448  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  97.02 
 
 
237 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  95.36 
 
 
237 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  69.35 
 
 
270 aa  346  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  69.6 
 
 
270 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  69.6 
 
 
270 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  69.6 
 
 
270 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  70.4 
 
 
254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  68.92 
 
 
256 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  68.92 
 
 
256 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  68.92 
 
 
256 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  67.46 
 
 
269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  66.27 
 
 
270 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  64.26 
 
 
271 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  64.26 
 
 
271 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  67.86 
 
 
269 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  64.08 
 
 
257 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  64.8 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  64.4 
 
 
265 aa  317  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  64.8 
 
 
265 aa  316  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  62.96 
 
 
250 aa  315  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  61.54 
 
 
257 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  60.32 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  62.8 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  60.55 
 
 
256 aa  308  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  61.45 
 
 
255 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  58.8 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  59.84 
 
 
269 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  59.84 
 
 
266 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  59.84 
 
 
266 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  59.84 
 
 
266 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  59.43 
 
 
269 aa  295  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  63.2 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  63.2 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  63.2 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  63.31 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  53.39 
 
 
250 aa  254  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  50.21 
 
 
260 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  48.74 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  51.22 
 
 
261 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  51.67 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  51.27 
 
 
267 aa  231  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  51.79 
 
 
267 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  46.61 
 
 
285 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  46.09 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  42.73 
 
 
267 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  40.68 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  38.57 
 
 
312 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  37.28 
 
 
281 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  38.56 
 
 
269 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  59.29 
 
 
141 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  42.15 
 
 
285 aa  161  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  38.02 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  41.55 
 
 
349 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  36.84 
 
 
272 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  34.09 
 
 
256 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  36.96 
 
 
246 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11994  integral membrane protein YrbE3a  55.56 
 
 
132 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
251 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 
251 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 
251 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.92 
 
 
258 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  35.46 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  37.7 
 
 
297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  31.49 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  30.25 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  34.35 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  34.35 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 
255 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  30.6 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  32.62 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  29.55 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  30.67 
 
 
250 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  32.61 
 
 
264 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  32.66 
 
 
366 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  32.66 
 
 
366 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  32.16 
 
 
366 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  29.88 
 
 
430 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.49 
 
 
271 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5634  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  54.13 
 
 
206 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.78 
 
 
267 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.1 
 
 
264 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.14 
 
 
270 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  29.41 
 
 
256 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  31.5 
 
 
406 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  30.59 
 
 
266 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.87 
 
 
270 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  30.22 
 
 
258 aa  102  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  36.25 
 
 
264 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29.96 
 
 
269 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  36.73 
 
 
268 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  33.63 
 
 
376 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  24.9 
 
 
268 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  31.74 
 
 
249 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>