More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2890 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  44.67 
 
 
257 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  44.3 
 
 
256 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  46.26 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  46.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  45.18 
 
 
270 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  44.89 
 
 
268 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  45.81 
 
 
257 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  40.86 
 
 
256 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  45.53 
 
 
260 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  41.34 
 
 
253 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  42.98 
 
 
264 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  41.83 
 
 
258 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  36.89 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  39.36 
 
 
261 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  44.07 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  44.07 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  43.64 
 
 
260 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  41.92 
 
 
256 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  40.32 
 
 
257 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  42.55 
 
 
256 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  40.17 
 
 
246 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  41.18 
 
 
258 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  41.18 
 
 
258 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  42.4 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  40.99 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  40.93 
 
 
256 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  39.91 
 
 
257 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  43.06 
 
 
260 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  40.35 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  39.39 
 
 
250 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  40.09 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  42.06 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  40.17 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  42.73 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  37.23 
 
 
263 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  37.23 
 
 
263 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  37.14 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  39.91 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  40.97 
 
 
265 aa  161  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  39.56 
 
 
247 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  38.86 
 
 
267 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  40.09 
 
 
380 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.04 
 
 
269 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  38.7 
 
 
263 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  36.55 
 
 
258 aa  159  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  41.31 
 
 
266 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  39.13 
 
 
260 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  40.74 
 
 
250 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  40.64 
 
 
258 aa  158  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  37.28 
 
 
263 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  36.48 
 
 
264 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  36.69 
 
 
269 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  37.96 
 
 
264 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  36.89 
 
 
264 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  37.33 
 
 
260 aa  156  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  37.39 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  43.56 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  38.39 
 
 
263 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  35.78 
 
 
267 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  37.95 
 
 
384 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  38.86 
 
 
377 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  35.25 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36.91 
 
 
270 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  35.25 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  37.39 
 
 
245 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  37.45 
 
 
258 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  36.84 
 
 
264 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  37.9 
 
 
262 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  37.23 
 
 
366 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  34.96 
 
 
258 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  35.17 
 
 
375 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  36.21 
 
 
260 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  36.21 
 
 
260 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  35.59 
 
 
263 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.74 
 
 
386 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.11 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
366 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  38.6 
 
 
265 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  38.53 
 
 
366 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  37.14 
 
 
266 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  37.27 
 
 
406 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  33.93 
 
 
265 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  37.74 
 
 
372 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  34.93 
 
 
382 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 
251 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  36.16 
 
 
251 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  36.16 
 
 
251 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
248 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  35.83 
 
 
258 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  35.04 
 
 
264 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  37.8 
 
 
266 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  36.57 
 
 
260 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  36.65 
 
 
365 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  35.71 
 
 
265 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  35.71 
 
 
265 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.61 
 
 
364 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  36.2 
 
 
255 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  36.61 
 
 
382 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>