More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0442 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  89.76 
 
 
264 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  89.37 
 
 
264 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  82.28 
 
 
264 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  86.72 
 
 
264 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  86.29 
 
 
264 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  84.65 
 
 
264 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  35.25 
 
 
258 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  34.98 
 
 
257 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  36.28 
 
 
256 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.51 
 
 
246 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.67 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.93 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  35.11 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  34.67 
 
 
258 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  35.21 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.91 
 
 
263 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.74 
 
 
264 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  33.48 
 
 
256 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  35.43 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  35.48 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  35.68 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  35.85 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  35.85 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.72 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  34.16 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  31.56 
 
 
269 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  34.23 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  33.74 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  35.86 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  31.62 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  34.36 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.18 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  36.18 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  31.22 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.49 
 
 
266 aa  125  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  30.6 
 
 
250 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 
267 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.41 
 
 
270 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.08 
 
 
267 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  32.44 
 
 
266 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  122  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.84 
 
 
251 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  31.03 
 
 
260 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  31.03 
 
 
260 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  31.03 
 
 
260 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  33.01 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  30.53 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  30.53 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  36.84 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  33.96 
 
 
406 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.65 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  34.36 
 
 
430 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  29.72 
 
 
377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  27.64 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  32.74 
 
 
261 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.02 
 
 
264 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.94 
 
 
251 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.85 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  32.66 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.94 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  33.49 
 
 
387 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  31.7 
 
 
261 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  31.7 
 
 
261 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  31.7 
 
 
261 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  31.7 
 
 
261 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  29.23 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  30.04 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  32.16 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  32.62 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  34.72 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  31.3 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  31.08 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  31 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  33.18 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  32.23 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  31.28 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  30.47 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  30.47 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  34.5 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  31.14 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  31.14 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  30.42 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  30.13 
 
 
260 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  32.74 
 
 
249 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  35.61 
 
 
258 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.57 
 
 
375 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  29.02 
 
 
265 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  31.88 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  31.25 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  31.66 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  31.25 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.02 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  34.17 
 
 
366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  31.28 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.05 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>