More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0895 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  99.6 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  81.3 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  81.22 
 
 		 248 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  73.77 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  71.37 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  70.4 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  71.49 
 
 		 251 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  70.8 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14851  putative transporter, membrane component  68.8 
 
 		 251 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  45.87 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  45.45 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  44.18 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  47.46 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  45.04 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  42.51 
 
 		 261 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  45.87 
 
 		 265 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  48.28 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  44.21 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  44.21 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  42.74 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26876  ABC(membrane) family transporter: toluene tolerance  39.43 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.54 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  36.52 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  36.32 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  37.14 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  35.19 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  34.3 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  38.68 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.53 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.07 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  37.44 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  37.61 
 
 		 375 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.27 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  31.14 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  34.91 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  30.38 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.9 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.8 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.31 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  34.4 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  32.57 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  31.48 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.55 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  35 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  31.95 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  30.91 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  30.7 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  31.94 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.49 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  33.02 
 
 		 393 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  29.66 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.96 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  29.84 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  29.24 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  39.02 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  33.75 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  31.2 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.68 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  31.76 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  32.52 
 
 		 369 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  30.37 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  31.76 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  30.37 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  30.4 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  30.37 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  30.37 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  30.37 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  30.37 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  29.96 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  30.37 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  31.13 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  30.84 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  31.42 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  31.42 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  38.86 
 
 		 382 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  32.09 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.71 
 
 		 386 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.63 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.49 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  34.91 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.56 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  32.41 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  31.9 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.43 
 
 		 376 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  32.11 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  32.16 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  30.74 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  31.78 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  31.03 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  29.31 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  35.1 
 
 		 372 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  32.4 
 
 		 366 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  33.76 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>