More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  100 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  81.3 
 
 
249 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  81.63 
 
 
249 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  78.54 
 
 
248 aa  407  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  79.76 
 
 
249 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  78.14 
 
 
249 aa  394  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  71.6 
 
 
251 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  71.2 
 
 
251 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  71.6 
 
 
251 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14851  putative transporter, membrane component  69.2 
 
 
251 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  45.9 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  44.63 
 
 
266 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  44.86 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  42.46 
 
 
263 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  43.39 
 
 
264 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  44.73 
 
 
248 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  44.63 
 
 
263 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  44.63 
 
 
263 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  46.12 
 
 
249 aa  201  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  41.74 
 
 
265 aa  200  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  42.92 
 
 
255 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26876  ABC(membrane) family transporter: toluene tolerance  39.11 
 
 
308 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  37.56 
 
 
269 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 
251 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  36.48 
 
 
251 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  36.69 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  36.05 
 
 
251 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  36.82 
 
 
250 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  35.98 
 
 
264 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  37.38 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  34.43 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.92 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 
260 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  35.68 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  32.51 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.51 
 
 
250 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  32.51 
 
 
258 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.16 
 
 
256 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.74 
 
 
255 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.55 
 
 
260 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  35.19 
 
 
375 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  30.58 
 
 
256 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  34.03 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  29.63 
 
 
268 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  28.69 
 
 
246 aa  119  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.8 
 
 
267 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.28 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.07 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.19 
 
 
267 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.28 
 
 
258 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  33.47 
 
 
369 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  34.78 
 
 
253 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  34.72 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  36.32 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  33.5 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  31.82 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  35.38 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  32.24 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  31.16 
 
 
393 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  31.13 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  31.98 
 
 
247 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  32.27 
 
 
362 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.56 
 
 
270 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  29.3 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  33.47 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  30.96 
 
 
245 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  29.91 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.71 
 
 
270 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.1 
 
 
386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.87 
 
 
382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  32.27 
 
 
384 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  29.91 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  29.44 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  29.91 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  32.41 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  31.43 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  34.71 
 
 
256 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  29.91 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  30.88 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.77 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  27.39 
 
 
260 aa  109  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  31.43 
 
 
265 aa  109  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  34.47 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  33.53 
 
 
258 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  29.49 
 
 
255 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  29.49 
 
 
255 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  33.02 
 
 
258 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.91 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  29.49 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 
271 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  29.49 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  29.49 
 
 
255 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  31.98 
 
 
389 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  29.49 
 
 
255 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  34.43 
 
 
257 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  30.66 
 
 
376 aa  105  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>