More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15101 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  98.8 
 
 
251 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  95.22 
 
 
251 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14851  putative transporter, membrane component  92.83 
 
 
251 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  71.6 
 
 
248 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  72 
 
 
249 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  71.49 
 
 
249 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  70.52 
 
 
248 aa  351  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  66.53 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  63.75 
 
 
249 aa  334  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  44.86 
 
 
263 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  42.68 
 
 
266 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  45.64 
 
 
249 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  42.74 
 
 
248 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  42.91 
 
 
264 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  42.68 
 
 
264 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  42.04 
 
 
263 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  42.04 
 
 
263 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  44.03 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  41.32 
 
 
261 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  38.52 
 
 
255 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.93 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  34.09 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.8 
 
 
251 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26876  ABC(membrane) family transporter: toluene tolerance  36.77 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  30.68 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  37.44 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 
251 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 
251 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  29.84 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.43 
 
 
257 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  35.06 
 
 
266 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.62 
 
 
256 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.19 
 
 
250 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.22 
 
 
256 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.88 
 
 
257 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.79 
 
 
375 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  33.74 
 
 
256 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.68 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  33.18 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  35.05 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.26 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.36 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  32.59 
 
 
369 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  32.38 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  30.08 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  30.62 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  33.47 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  31.22 
 
 
370 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  30.47 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  32.5 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.82 
 
 
258 aa  115  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  31.65 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.93 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  32.79 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  32.65 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.63 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  32.74 
 
 
260 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  32.74 
 
 
260 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  33.02 
 
 
260 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  30.41 
 
 
261 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  30.97 
 
 
285 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  32.74 
 
 
384 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.24 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.56 
 
 
270 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  32.56 
 
 
265 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  31.17 
 
 
245 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  33.79 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  30.2 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  33.02 
 
 
382 aa  111  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  33.49 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  30.12 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  30.64 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.5 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  30.64 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  27.76 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.78 
 
 
386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  33.02 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  30.92 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  33.77 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  33.02 
 
 
265 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  31.19 
 
 
265 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  31.19 
 
 
260 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  31.19 
 
 
260 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  31.19 
 
 
260 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  31.19 
 
 
260 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  33.02 
 
 
265 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  29.61 
 
 
261 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  27.76 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  31.16 
 
 
247 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  29.24 
 
 
267 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  31.16 
 
 
255 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  30.17 
 
 
268 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  29.74 
 
 
260 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  30.7 
 
 
265 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  32.57 
 
 
260 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>