More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0685 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  46.99 
 
 
257 aa  214  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  44.53 
 
 
258 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  44.98 
 
 
255 aa  204  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  42.08 
 
 
258 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  41.67 
 
 
258 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  43.26 
 
 
257 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  38.27 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  40.19 
 
 
257 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  43.21 
 
 
260 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  39.39 
 
 
258 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  45.05 
 
 
375 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  43.96 
 
 
260 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  36.73 
 
 
264 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.29 
 
 
256 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  36.02 
 
 
265 aa  154  9e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  34.32 
 
 
260 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  34.71 
 
 
261 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  42 
 
 
382 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  42.58 
 
 
362 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  36.07 
 
 
257 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.32 
 
 
266 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.83 
 
 
257 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  34.86 
 
 
263 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  34.86 
 
 
263 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  34.75 
 
 
275 aa  148  6e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  40.8 
 
 
380 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  37.25 
 
 
266 aa  148  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.85 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.81 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  42.08 
 
 
386 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  37.16 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  36.7 
 
 
246 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  35.4 
 
 
378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  35.77 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  36.67 
 
 
250 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  41.01 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.78 
 
 
257 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  36.44 
 
 
328 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.12 
 
 
413 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  36.86 
 
 
268 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  35.51 
 
 
267 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  39.61 
 
 
376 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  35.24 
 
 
261 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  36.49 
 
 
264 aa  141  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  33.78 
 
 
378 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  35.22 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  37.73 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  33.62 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  36.53 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  33.74 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  34.15 
 
 
258 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.8 
 
 
264 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  33.48 
 
 
378 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  33.78 
 
 
378 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  35.19 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  36.53 
 
 
260 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  33.47 
 
 
270 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  38.54 
 
 
376 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  37.28 
 
 
372 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  34.4 
 
 
264 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  36.28 
 
 
263 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  34.26 
 
 
248 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  32.58 
 
 
370 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  34.58 
 
 
258 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.51 
 
 
251 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  36.84 
 
 
384 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  34.88 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  35.02 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  34.62 
 
 
388 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  32.51 
 
 
251 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.51 
 
 
251 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  34.19 
 
 
393 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.06 
 
 
267 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  36.97 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  36.4 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  35.59 
 
 
260 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  35.62 
 
 
382 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  33.17 
 
 
382 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  37.38 
 
 
379 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  33.61 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  35.16 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  36.7 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  36.7 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  32.64 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  35.12 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  36.7 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  36.24 
 
 
255 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  37.38 
 
 
374 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  32.65 
 
 
370 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  37.38 
 
 
374 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  35.64 
 
 
374 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  36.24 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  36.24 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  34.54 
 
 
269 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  40.87 
 
 
261 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  34.88 
 
 
249 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>