More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1780 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  507  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  74.9 
 
 		 260 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  73.36 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  73.36 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  78 
 
 		 258 aa  359  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  68.73 
 
 		 260 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  61.75 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  56.05 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  52.17 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  52.14 
 
 		 270 aa  264  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  62 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  52.12 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  53.63 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  52.4 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  41.6 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  42.51 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  40.49 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  39.7 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  38.76 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  39.26 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  41.23 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  41.23 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  38.94 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  39.83 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  43.06 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  38.89 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  41.45 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  37.07 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  39.68 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  39.24 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  38.08 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  38.77 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  39.38 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  39.19 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  38.05 
 
 		 265 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  35.32 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  37.4 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.49 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  34.77 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  37.3 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  40.18 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  39.47 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  35.34 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  34.96 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  34.92 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  38.05 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  37.02 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  33.72 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  33.72 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  38.18 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.41 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  37.16 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  35.78 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.16 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  34.5 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  36.1 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  37.61 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  32.81 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  33.59 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  32.81 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  32.81 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.41 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 		 251 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  40.18 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35.93 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.61 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  37.73 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35.93 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  33.2 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  33.2 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  32.94 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  31.42 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  35.32 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  32.54 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  32.43 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  30.59 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.73 
 
 		 380 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  36.44 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  31.87 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  35.09 
 
 		 376 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  30.42 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  38.99 
 
 		 375 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  30.56 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  33.03 
 
 		 258 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  36.73 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1817  toluene tolerance protein  35.66 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1749  hypothetical protein  35.66 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.627131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  32.68 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  32.6 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  33.03 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  33.75 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  38.22 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  30.04 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  32.42 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>