More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3690 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  64.43 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  64.43 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  65.22 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  62 
 
 		 260 aa  294  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  61.26 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  56.69 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  54.12 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  52.16 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  58.87 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  54.1 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  51.76 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  48.39 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  39.04 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  41.94 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  42.23 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  40.68 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  43.55 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  44.25 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  44.05 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  40.91 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  42.38 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  41.28 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  38.8 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  38.8 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  40.6 
 
 		 265 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  38.19 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  42.74 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  39.75 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  36.9 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  41.8 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  40.6 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  38 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  42.66 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  41.25 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  35.97 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  43.87 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  41.34 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  37.2 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  38.67 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.91 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  40.97 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  40.54 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  40.52 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.83 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  40 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  39.83 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  39.83 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  38.5 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  38.49 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  36.15 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  38.67 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  42.92 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  39.17 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.6 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  35.38 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  35 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  39.32 
 
 		 380 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  35 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  33.98 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  37.17 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1817  toluene tolerance protein  39.27 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  37.11 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1749  hypothetical protein  39.27 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.627131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 		 328 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  37.16 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  34.62 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  37.44 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  38.33 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  34.62 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  36.72 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  34.62 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  33.85 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  34.24 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  40.52 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4017  protein of unknown function DUF140  36.78 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0789567  normal  0.274799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  33.46 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  35.07 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  33.85 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  34.74 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  37.21 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  38.03 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  33.2 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  39.5 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  34.25 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  39.72 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  37.33 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  35.81 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  33.64 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>