More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2459 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  96.15 
 
 
260 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  73.36 
 
 
260 aa  377  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  73.46 
 
 
260 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  75.49 
 
 
258 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  63.64 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  59.92 
 
 
257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  59.85 
 
 
270 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  60.71 
 
 
268 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  54 
 
 
264 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  57.09 
 
 
260 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  64.43 
 
 
252 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  57.09 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  47.6 
 
 
256 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  43.67 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  46.25 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  43.48 
 
 
265 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  46.64 
 
 
256 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  45.2 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  44 
 
 
261 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  44.25 
 
 
246 aa  188  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  44.4 
 
 
257 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  44.07 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  39.44 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  40.23 
 
 
267 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  39.04 
 
 
258 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  40.34 
 
 
263 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  40.34 
 
 
263 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 
266 aa  176  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  37.05 
 
 
263 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  42.42 
 
 
245 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  40.69 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  41.22 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  39.84 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  42.17 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  43.36 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  44.05 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  39.92 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  36.43 
 
 
265 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 
250 aa  169  4e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  40.69 
 
 
249 aa  168  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  39.06 
 
 
264 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  38.89 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  40.91 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  40.39 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  38.58 
 
 
263 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  37.3 
 
 
258 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  41.15 
 
 
260 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  39.76 
 
 
269 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  41.59 
 
 
253 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  39.83 
 
 
264 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  38.49 
 
 
256 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  38.63 
 
 
248 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  37.19 
 
 
263 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  40.74 
 
 
247 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  41.05 
 
 
256 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  40.7 
 
 
258 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  38.57 
 
 
269 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  38.08 
 
 
267 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  36.08 
 
 
265 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.12 
 
 
266 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  39.9 
 
 
380 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  35.06 
 
 
269 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  36.99 
 
 
268 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  36.11 
 
 
265 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  36.25 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  38.84 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  37.61 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  35.86 
 
 
258 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  33.46 
 
 
258 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  38.89 
 
 
328 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  34.5 
 
 
260 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  35.52 
 
 
265 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  34.12 
 
 
260 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  34.12 
 
 
260 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 
271 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  33.73 
 
 
265 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  34.13 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  40 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  34.13 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  32.51 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.53 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  34.13 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  34.13 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  34.77 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  34.77 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  34.77 
 
 
255 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  34.77 
 
 
255 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  34.38 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  35.32 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  37.61 
 
 
255 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 
266 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  34.08 
 
 
265 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.35 
 
 
376 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>