More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1211 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  55.79 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  53.78 
 
 		 242 aa  265  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  51.04 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  49.78 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  44.77 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  46.78 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  43.32 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  45.22 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  45.41 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  43.04 
 
 		 245 aa  202  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  37.33 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  32.87 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  35.5 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  37.04 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.98 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  34.43 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  37.56 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.68 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  32.51 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  32.73 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  37.21 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.54 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.12 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  32.49 
 
 		 380 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  35.02 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.14 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  31.69 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  34.45 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.1 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  32.93 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.65 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.87 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  29.91 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  33.94 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  31.98 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.05 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  34.82 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  29.17 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  32.49 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  29.17 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  30.08 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32.11 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  31.48 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  28.15 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  35.48 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  34.58 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.2 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.2 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  31.56 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  34.58 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.46 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  29.3 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.49 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.46 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  29.44 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  29.44 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  29.44 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30.25 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  29.44 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  31.28 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  28.57 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  30.2 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  28.7 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  32.11 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  28.24 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  32.75 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  29.95 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  28.51 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  28.51 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  34.15 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  28.51 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  32.58 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  27.92 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  27.23 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  28.51 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  28.69 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  34.12 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  30.91 
 
 		 376 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  30.36 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  31.05 
 
 		 374 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  30.86 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  29.92 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  30.3 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  30.41 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.28 
 
 		 377 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  34.11 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  33.19 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>