More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2194 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  64.46 
 
 		 242 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  62.81 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  50.42 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  50.21 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  53.28 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  46.58 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  44.12 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  46.96 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  40.93 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  45.37 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  37.22 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  36.75 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  34.55 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  35.65 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  35.17 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  34.6 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  35.25 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.26 
 
 		 380 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  34.33 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.47 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.47 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  34.87 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  34.87 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  36.61 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.76 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.26 
 
 		 377 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  36.24 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  31.06 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.13 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  36.51 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.56 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  32.79 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29.51 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.58 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  32.09 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  30.92 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.16 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  32.3 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  29.71 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  34.44 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  34.5 
 
 		 386 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.8 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.98 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.95 
 
 		 266 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.57 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  30.45 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  32.61 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.94 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  30.45 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  31.17 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  33.5 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  33.66 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.73 
 
 		 370 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  30.96 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  31.06 
 
 		 372 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  30.73 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  34.91 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  31.08 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  32.29 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  31.08 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  30.67 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  37.04 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 		 374 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  34.98 
 
 		 384 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  30.49 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  31.97 
 
 		 374 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  31.97 
 
 		 447 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.53 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  29.37 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  32 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  30 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.54 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.37 
 
 		 379 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.53 
 
 		 375 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  29.82 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  32.86 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  28.88 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.55 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  31.89 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  29.64 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  31 
 
 		 382 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  30.3 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  30.57 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  35.44 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 		 376 aa  99.8  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.1 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  29.36 
 
 		 365 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  26.54 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>