More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3962 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  66.94 
 
 		 243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  63.04 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  53.78 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  56.33 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  52.52 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  47.19 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  45.04 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  47.58 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  45.85 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  41.49 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  37.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  36.17 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  36.17 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  39.45 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  39.46 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  36.24 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  35.14 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  38.67 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  37.44 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.65 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.61 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36.68 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  34.41 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.07 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  36.07 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  36.07 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.87 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  35.02 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  36.82 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  34.04 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  38.86 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  33.79 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  34.96 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.8 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.92 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  33.96 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  32.23 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.4 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  31.43 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  33.64 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  34.86 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  32.91 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  35.24 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  34.56 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  33.94 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  33.48 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  35.24 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  37.33 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.03 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 413 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.41 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  35.75 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  33.2 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  33.63 
 
 		 260 aa  111  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  35.07 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  34.7 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  36.07 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  36.44 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  31.95 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  29.24 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  34.88 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  30.61 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  30.91 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  30.83 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  33.33 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  30.64 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  29.41 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  28.75 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  31.9 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  35.05 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  30.17 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  34.82 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  32.2 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.23 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.98 
 
 		 328 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  33.64 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.07 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  28.33 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  31.63 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  30.42 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  28.69 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  36.41 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  32.43 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  35.9 
 
 		 386 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  31.07 
 
 		 383 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  32.24 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  32.24 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  34.06 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>