More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2252 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  87.12 
 
 		 264 aa  454  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  90.59 
 
 		 264 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  88.64 
 
 		 264 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  83.27 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  89.37 
 
 		 256 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  85.16 
 
 		 264 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  35.25 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  33.98 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  35.35 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  33.9 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.17 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  32.93 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  34.02 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  32.88 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32.03 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  32.13 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.33 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.47 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.88 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  33.62 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  32.05 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  33.78 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  33.78 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  34.87 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  34.31 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.34 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  34.57 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  35.86 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  34.4 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  32.43 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  32.07 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  34.82 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  33.77 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.8 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  33.61 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  31.86 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  36.12 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  29.57 
 
 		 261 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.48 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  34.6 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  32.07 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  31.76 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  31.9 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.61 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.61 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  34.33 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.61 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  36.28 
 
 		 430 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  30.56 
 
 		 377 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  30.04 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  33.01 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  32.62 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  32.64 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  32.62 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  36.27 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  31.38 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  31 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  32.41 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  32.72 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  32.66 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.43 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  30.8 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  32.9 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  33.18 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.38 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 413 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  32.02 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  32.02 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.9 
 
 		 328 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  32.02 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  31.55 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  32.76 
 
 		 406 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  29.36 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  31.03 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  31.32 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>