60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11994 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11994  integral membrane protein YrbE3a  100 
 
 
132 aa  265  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  64.91 
 
 
257 aa  156  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  64.91 
 
 
255 aa  154  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  66.97 
 
 
255 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  61.21 
 
 
256 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  66.06 
 
 
257 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  62.73 
 
 
269 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  62.73 
 
 
266 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  62.73 
 
 
266 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  62.73 
 
 
266 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  61.82 
 
 
269 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  63.3 
 
 
271 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  63.3 
 
 
271 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  63.3 
 
 
250 aa  137  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  57.8 
 
 
255 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  56.48 
 
 
254 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  58.1 
 
 
269 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  55.96 
 
 
256 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  55.96 
 
 
256 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  55.96 
 
 
256 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  56.48 
 
 
254 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  55.56 
 
 
270 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  55.56 
 
 
270 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  55.56 
 
 
270 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  53.7 
 
 
254 aa  123  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  50.85 
 
 
265 aa  122  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  56.19 
 
 
269 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  61.47 
 
 
255 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5634  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  58.95 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639594  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  58.16 
 
 
237 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  49.22 
 
 
270 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  58.16 
 
 
237 aa  116  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  49.22 
 
 
270 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  50 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  47.54 
 
 
265 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  51.28 
 
 
265 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  51.28 
 
 
265 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  51.28 
 
 
265 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  46.9 
 
 
265 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  41.75 
 
 
250 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  39.06 
 
 
267 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  39.42 
 
 
285 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  38.83 
 
 
260 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  39.81 
 
 
267 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  41.74 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  34.95 
 
 
268 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  38.04 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  29.66 
 
 
267 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  32.69 
 
 
257 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  28.12 
 
 
281 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  32 
 
 
285 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  28.12 
 
 
312 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  29.51 
 
 
269 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  31.11 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  30.86 
 
 
297 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  26.8 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  31.53 
 
 
285 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>