More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1839 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  733    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  52.21 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  52.73 
 
 		 382 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  55.49 
 
 		 377 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  53.99 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  55.22 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  51.57 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  50.53 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  51.46 
 
 		 381 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  54.27 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  51.46 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  54.67 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  48.56 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  43.62 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  44.35 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  40.05 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  39.78 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  40.78 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  40.21 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  43.07 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  41.55 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  42.6 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  38.9 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  39.12 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  42.09 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  38.69 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  38.59 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  38.66 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  38.15 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.76 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  39.63 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  37.82 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  40.1 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  37.94 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  40.85 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  40.24 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  37.73 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  40.18 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  39.34 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  39.34 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  38.94 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  36.01 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  40.53 
 
 		 377 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  35.75 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  35.99 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  43.15 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  36.77 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  36.01 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.36 
 
 		 376 aa  202  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  39.45 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  35.04 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  34.03 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  35 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  36.64 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  35.97 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.24 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  36.44 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  36.27 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.14 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  34.66 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.12 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  32.73 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.35 
 
 		 378 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.03 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  32.73 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  36.86 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  37.12 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.42 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  31.2 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  30.59 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  35.68 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  33.66 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  40.36 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  39.23 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.55 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  35.84 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  31.59 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  35.17 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.02 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.26 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  32.27 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  36.25 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  36.67 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  35.86 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  35.6 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.3 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.3 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  34.56 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  33.6 
 
 		 378 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 378 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  34.39 
 
 		 374 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.77 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.94 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.08 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  34.39 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  36.02 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  35 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  32.8 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>