More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6291 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6291  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1831  hypothetical protein  52.67 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000783197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.09 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  33.13 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.44 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  34.22 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  33.02 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  35.66 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.42 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  32.84 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  32.42 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5507  hypothetical protein  38.17 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  32.58 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  33.02 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.55 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  35.89 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.5 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  34.41 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.64 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.21 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  33.67 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.53 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  34.19 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  33.88 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.33 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  34.42 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.48 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  31.25 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  34.08 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  32.84 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  35.28 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  32.72 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  29.82 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  32.44 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1881  hypothetical protein  33.56 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  33.11 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  32.1 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  31.6 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  32.63 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  32.53 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  33.45 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  32.31 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  31.07 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  34.62 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  34.62 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.79 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  32.12 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  33.45 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  31.38 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  32.38 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  30.65 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  31.53 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.76 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.55 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  35.03 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  34.22 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  30.84 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  31.38 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  32.8 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  33.45 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  35.88 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  36.43 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  30.97 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.11 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  30.86 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.08 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  32 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  34.51 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  32.18 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  32.33 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  32.78 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  32.88 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  30.84 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.96 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  32.6 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  32.91 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  32.67 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  32.13 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  32.91 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  35.06 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3320  hypothetical protein  30.12 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  33.77 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  32.09 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  31.67 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  33.21 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  30.99 
 
 		 395 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  34.29 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  34.07 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  30.72 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  31.49 
 
 		 698 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  32.2 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  31.8 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  31.03 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>