More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5050 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  77.54 
 
 		 353 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  73.37 
 
 		 330 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1664  hypothetical protein  49.54 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  44.09 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  46.46 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  44.63 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  42.96 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2008  hypothetical protein  40.48 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  39.31 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.94 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.2 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.5 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  38.27 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  37.58 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.78 
 
 		 358 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.84 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.49 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.7 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  41.06 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.12 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.12 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  38.74 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  38.21 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  36.54 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.86 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  34.06 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.07 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  37.66 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.48 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.8 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.13 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  39.15 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  39.15 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  38.7 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  40.4 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.53 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.65 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.33 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  38.89 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.32 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.53 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.85 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  37.09 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.01 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.45 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  39.46 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.22 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.41 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.45 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.61 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.72 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.79 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.46 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.65 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.89 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  38.23 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.73 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  36.1 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.39 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.33 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  37.7 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  36.18 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.33 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.37 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  35.24 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  36.86 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.38 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  33.53 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  33.84 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.22 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.2 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.2 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.45 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.18 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.39 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  36.15 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.05 
 
 		 304 aa  192  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  36.28 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.05 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.91 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  37.05 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.52 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  37.88 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  38.95 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  34.58 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.79 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.55 
 
 		 355 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>